Biomamba 生信基地與西柚云超算攜手,大禹系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)資源獨(dú)享與穩(wěn)定云計(jì)算
西柚云的大禹系統(tǒng)終于與大家見面了!期待已久,這個系統(tǒng)對從事生物信息分析的朋友們來說,實(shí)用性極高。眾多功能都是我們迫切需要的,真是個讓人興奮的消息。
管理員權(quán)限與無損遷移
大禹系統(tǒng)的每位用戶都享有管理員權(quán)限,這一設(shè)置極其實(shí)用。在計(jì)算節(jié)點(diǎn)擁堵時,用戶可輕松實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)無損遷移。比如,那些從事單細(xì)胞測序研究的學(xué)者,他們的數(shù)據(jù)集通常龐大,對計(jì)算資源的需求持續(xù)攀升。一般筆記本的配置遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠。我曾遇見一位研究員,他需要處理的數(shù)據(jù)集達(dá)百萬細(xì)胞級別,8G內(nèi)存的筆記本根本無法滿足需求。這種權(quán)限賦予了用戶在資源分配上的高度自主權(quán),讓他們不必因計(jì)算資源不足而憂慮。
大禹系統(tǒng)的一鍵遷移功能十分周到。就拿一些大型項(xiàng)目來說,臨近截止日期時,若突然遭遇計(jì)算資源不足的問題,這項(xiàng)功能便能迅速解決難題,保證項(xiàng)目能夠順利進(jìn)行。
近似獨(dú)享計(jì)算資源
大禹系統(tǒng)實(shí)屬獨(dú)占資源。若個人賬戶無計(jì)算任務(wù),其配置將完全閑置,不會與他人共享計(jì)算資源。特別是在處理那些較為復(fù)雜的生物信息分析任務(wù)時,若與他人共享資源,極易產(chǎn)生相互干擾。我的一位同事曾在某共享資源平臺上進(jìn)行過分析工作,卻常常因他人任務(wù)沖突而受到影響。
對于深入研究的需求者來說,這種近乎獨(dú)享的資源配置,可讓他們按自己的節(jié)奏和需求進(jìn)行深入分析。無需擔(dān)憂資源在關(guān)鍵時被他人搶占,效率因而顯著提升。
預(yù)裝大量生信軟件
大禹系統(tǒng)內(nèi)預(yù)裝了上千款生物信息學(xué)軟件和R包。進(jìn)行生物信息學(xué)分析時,環(huán)境配置和軟件安裝過程極其繁瑣。自行查找方法效率不高。一位朋友為了安裝一款特定的生物信息學(xué)軟件,在網(wǎng)上搜尋了三天安裝教程。而大禹系統(tǒng)則直接解決了這一難題。
實(shí)驗(yàn)室剛開始涉足生物信息學(xué)分析,科研人員得親自逐個安裝軟件,這一過程耗費(fèi)了整整兩周的時間在安裝和調(diào)試上。自從引入了大禹系統(tǒng),所有軟件都預(yù)先安裝好了,直接使用即可,大大節(jié)省了寶貴的時間和精力。
穩(wěn)定運(yùn)行不間斷
服務(wù)器在機(jī)房內(nèi)持續(xù)穩(wěn)定運(yùn)作,從不間斷。若你在本地電腦上執(zhí)行生物信息學(xué)分析任務(wù),運(yùn)行過程中若遭遇停電或網(wǎng)絡(luò)中斷,那么正在進(jìn)行的任務(wù)便會前功盡棄。我之前就遇到過這樣的情況,一個任務(wù)運(yùn)行了好幾天,結(jié)果突然斷電,之前的努力都白費(fèi)了。
在大禹系統(tǒng)中,即便本地電腦出現(xiàn)掉線或關(guān)機(jī)的情況,服務(wù)器仍會持續(xù)執(zhí)行任務(wù)。無論是Linux系統(tǒng)下掛載使用,還是使用特定方式運(yùn)行,都不會受到此問題的困擾。它就像一位守護(hù)天使,極大地減輕了我們的煩惱。
專線接入高速穩(wěn)定
大禹系統(tǒng),每臺都接入1000M專線,并且已經(jīng)正規(guī)備案。這和校園網(wǎng)的體驗(yàn)大相徑庭。即便訪問境外數(shù)據(jù)庫,速度也絲毫不減。我曾用校園網(wǎng)下載過境外數(shù)據(jù)庫資料,速度極慢。而大禹系統(tǒng),即便是用wget這樣的簡單命令,下載速度也非常快。有時,它甚至比百度云還要方便。有個學(xué)生就說過,他下載一個大型生物數(shù)據(jù),在百度云要等好幾天,但大禹系統(tǒng)很快就下載完成了。
免費(fèi)版帶來體驗(yàn)機(jī)會
大禹系統(tǒng)設(shè)有免費(fèi)版,方便大家學(xué)習(xí)試用。它提供128GB的配置,且可免費(fèi)使用一小時。這對想要學(xué)習(xí)生物信息分析的人來說,非常有幫助。就有位初學(xué)者,他先是通過免費(fèi)版來學(xué)習(xí)我的教程。等到運(yùn)算需求增多時,再考慮購買。免費(fèi)版就像一把鑰匙,幫助人們開啟探索大禹系統(tǒng)的大門。這樣的設(shè)計(jì),顯得非常人性化。
大家覺得,這款大禹系統(tǒng)如此出色,會對生信分析領(lǐng)域產(chǎn)生怎樣的深遠(yuǎn)影響?歡迎大家在評論區(qū)留言討論,別忘了點(diǎn)贊和轉(zhuǎn)發(fā)。
作者:小藍(lán)
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